Tutte le attività dell'ECAP vengono svolte secondo i principi stabiliti nella Carta della qualità, approvata dal Consiglio di Fondazione nel dicembre del 2003. L’applicazione dei principi della Carta è regolata nel documento «Sviluppo della qualità nella nostra organizzazione» elaborato nel 2005 e costantemente aggiornato. Entrambi questi documenti sono la base per la definizione dei nostri obiettivi annuali e per la progettazione, la valutazione e il controllo delle attività formative.

Il lavoro di ECAP è certificato eduQua, il certificato svizzero di qualità per le organizzazioni della formazione continua. In molti cantoni il certificato eduQua è un requisito fondamentale per ricevere sovvenzioni pubbliche.